متن پیام مرجع عالیقدر آیتاللهالعظمی سیستانی به این شرح است:
بسم الله الرحمن الرحیم
إنا لله و إنا إلیه راجعون
درگذشت مرجع بزرگ و فقیه اهلبیت عصمت و طهارت (علیهمالسلام)، آیتالله حاج سید موسی شبیری زنجانی (رضواناللهعلیه)، مصیبتی دردناک و ضایعهای بزرگ است.
آن عالم جلیلالقدر که تمام عمر پربرکت خویش را در راه تحقیق و تعلیم سپری کرد، از علمای بزرگ و نامآور و از استوانههای حوزۀ علمیۀ مبارکۀ قم و از شاگردان برجستۀ عالم ربانی بود.
آثار علمی ارزشمند و دیگر خدمات دینی ایشان، میراثی گرانبها باقی خواهد ماند؛ همچنانکه سیره و روش علمی ایشان همواره الگویی ماندگار برای اهل علم خواهد بود.
خداوند مقام شریف ایشان را رفعت بخشد و او را با اجداد پاک و مطهرش محشور فرماید.
اینجانب با نهایت اندوه و تأسف، این مصیبت بزرگ را به ساحت مقدس حضرت ولیعصر ارواحنا فداه، حوزههای علمیه، بستگان آن فقید سعید و محترم ـ بهویژه فرزندان گرامی ایشان ـ و عموم مؤمنان تسلیت عرض میکنم و از خداوند متعال برای همگان صبر جمیل و اجر جزیل مسئلت دارم.
و لا حول و لا قوه إلا بالله العلی العظیم
۹ ربیعالثانی ۱۴۴۸
علی الحسینی السیستانی