این توصیهها را حجتالاسلام شیخ جعفر نائینی، نوهٔ علامه نائینی (قدسسره)، در سخنرانی خود بیان کرد؛ و از مرجع عالیقدر آیتالله العظمى سید علی سیستانی بهخاطر حمایت و پیگیری ایشان در همهٔ مراحل برگزاری همایش، قدردانی نمود.
شیخ جعفر نائینی تأکید کرد:
«مرجع عالیقدر (دامظله) توصیه فرمودند که همایش باید در حد شأن و مقام این محقق بزرگ برگزار شود؛ بهویژه با توجه به حق عظیمی که ایشان بر گردن مسلمانان دارد؛ زیرا میرزا نائینی با تلاشهای علمی، پژوهشی، اخلاقی، تهذیبی و تربیت اندیشمندان بزرگ، حوزههای علمیه را غنی ساخت و نیز در راه مقابله با استعمار در عراق و مبارزه با ظلم و استبداد در ایران، سختیها و رنجهای فراوانی را بر دوش کشید.»
شایان ذکر است که این همایش، به همت آستان مقدس علوی در نجف اشرف برگزار شد؛ پساز آنکه نخستین دورهٔ آن در شهر مقدس قم برگزار شده بود.
همچنین قرار است مراسم اختتامیهٔ این دوره با برگزاری نشست سوم در حرم مطهر سیدالشهدا (علیهالسلام) انجام شود.
